Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PGGT1BP53609 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP53609 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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