Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GTF2A2P52657 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms