Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNT2P45379 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNT2P45379 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNNT2P45379 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNNT2P45379 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms