Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX7O95931 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CBX7O95931 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms