Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIX3O95343 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIX3O95343 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms