Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN11O75508 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms