Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRTO14522 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRTO14522 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
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