Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A6NL46 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A6NL46 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms