Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC17A6Q9P2U8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms