Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
HIGD1BQ9P298 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD1BQ9P298 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD1BQ9P298 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD1BQ9P298 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD1BQ9P298 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms