Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ROPN1BQ9BZX4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms