Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms