Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SALL3Q9BXA9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms