Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFHD1Q9BUP0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms