Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB6Q9BUF5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms