Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTKNQ9BST9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RTKNQ9BST9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms