Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP9Q99956 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms