Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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GTF3C6Q969F1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3C6Q969F1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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