Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RTL3Q8N8U3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTL3Q8N8U3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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