Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms