Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZNF56Q15929 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF56Q15929 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms