Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NCF4Q15080 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NCF4Q15080 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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