Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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