Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms