Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms