Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD2Q13200 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD2Q13200 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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