Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MKRN3Q13064 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN3Q13064 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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