Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms