Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFN5Q08AF3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms