Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE4DQ08499 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms