Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms