Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms