Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FAM3BP58499 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FAM3BP58499 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms