Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAD23AP54725 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAD23AP54725 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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