Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSOP43234 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSOP43234 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSOP43234 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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