Protein–RNA interactions for Protein: P36551

CPOX, Oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPOXP36551 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPOXP36551 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CPOXP36551 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms