Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPN7P35236 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms