Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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