Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms