Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EGR1P18146 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EGR1P18146 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EGR1P18146 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms