Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GM2AP17900 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GM2AP17900 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GM2AP17900 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms