Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZBED1O96006 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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