Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGTAO43765 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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