Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms