Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E9PBE3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E9PBE3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E9PBE3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms