Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms