Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms