Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM247A6NEH6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms