Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCAF1Q9Y4C2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms