Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
L1RE1Q9UN81 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms